Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TPD52L3Q96J77 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms