Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC51Q96ER9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms