Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCC1Q96CN9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCC1Q96CN9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms