Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EFHD2Q96C19 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
EFHD2Q96C19 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms