Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RFT1Q96AA3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms