Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKL1Q969V6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms