Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RFKQ969G6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms