Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPS3Q969F9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HPS3Q969F9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HPS3Q969F9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HPS3Q969F9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPS3Q969F9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HPS3Q969F9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms