Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DPF3Q92784 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms