Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TAF4BQ92750 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms