Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PHF3Q92576 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms