Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TOPBP1Q92547 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
TOPBP1Q92547 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TOPBP1Q92547 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms