Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS9Q8WXC6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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COPS9Q8WXC6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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COPS9Q8WXC6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
COPS9Q8WXC6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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