Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC4Q8WW27 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms