Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZNF548Q8NEK5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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ZNF548Q8NEK5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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ZNF548Q8NEK5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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ZNF548Q8NEK5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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ZNF548Q8NEK5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
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ZNF548Q8NEK5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNF548Q8NEK5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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