Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q1

CYB561D1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561D1Q8N8Q1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYB561D1Q8N8Q1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms