Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOT1Q8IXI2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RHOT1Q8IXI2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOT1Q8IXI2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms