Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NME9Q86XW9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NME9Q86XW9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms