Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKAP1Q86WV1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKAP1Q86WV1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms