Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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