Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRAPQ7Z569 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRAPQ7Z569 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms