Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUP54Q7Z3B4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUP54Q7Z3B4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms