Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTF1AQ7RTS3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTF1AQ7RTS3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms