Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
H2AFVQ71UI9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms