Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HACD2Q6Y1H2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms