Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CASC1Q6TDU7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CASC1Q6TDU7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms