Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms