Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPP4R4Q6NUP7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms