Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRNP1Q6NT89 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TRNP1Q6NT89 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms