Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102BQ68D86 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms