Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms