Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LDLRAD1Q5T700 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms