Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CC2D1BQ5T0F9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms