Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PHYHD1Q5SRE7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms