Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KCNT1Q5JUK3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNT1Q5JUK3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms