Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDK2Q58EX2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDK2Q58EX2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms