Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDCA8Q53HL2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDCA8Q53HL2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms