Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIF4BQ2VIQ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KIF4BQ2VIQ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms