Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC96Q2M329 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms