Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA9Q16795 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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