Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP2B3Q16720 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
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