Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDKN3Q16667 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKN3Q16667 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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