Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM1Q16610 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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