Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNAPC1Q16533 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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