Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDB1Q16531 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDB1Q16531 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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