Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ASIC2Q16515 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms