Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SSX1Q16384 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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SSX1Q16384 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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SSX1Q16384 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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SSX1Q16384 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX1Q16384 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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