Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC6Q16204 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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