Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USF2Q15853 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
USF2Q15853 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USF2Q15853 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USF2Q15853 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USF2Q15853 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
USF2Q15853 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
USF2Q15853 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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