Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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NR6A1Q15406 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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NR6A1Q15406 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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NR6A1Q15406 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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NR6A1Q15406 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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NR6A1Q15406 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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NR6A1Q15406 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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NR6A1Q15406 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NR6A1Q15406 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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